Schwerige Frage, denn beide kommen mit Android 10 und dem gleichen Prozessor, somit sollte die Performance gleich sein.
Auch die Triple-Kamera gleicht sich, bietet 3-fach Zoom, Weitwinkel, Nachtmodus usw. Die Frontkamera sogar mehr Megapixel beim FE-Modell. Zudem ist der Akku mit 4.500 mAh größer, als im Galaxy S20. Das Display ist beim S20 FE mit 6,5 Zoll größer, wodurch allerdings die Pixeldichte geringer ist. Das wird sich kaum bemerkbar machen. 5G haben beide nicht.
Ich würde da tatsächlich zum FE-Modell raten wegen des größeren Displays und wegen zeitlich längeren Updates, weil der Start erst jetzt im Oktober ist. Aber am besten du schaust Dir beide vor Ort im Markt mal an.